第25章 HPC 環境での Podman の使用

手順

1. Open MPI をインストールします。

   # dnf install openmpi

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2. 環境モジュールをアクティベートするには、以下を入力します。

   $ . /etc/profile.d/modules.sh

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3. mpi/openmpi-x86_64 モジュールを読み込みます。

   $ module load mpi/openmpi-x86_64

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   必要に応じて、mpi/openmpi-x86_64 モジュールを自動的に読み込むには、以下の行を .bashrc ファイルに追加します。

   $ echo "module load mpi/openmpi-x86_64" >> .bashrc

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4. mpirun と podman を統合するには、以下の定義でコンテナーを作成します。

   $ cat Containerfile
   FROM registry.access.redhat.com/ubi9/ubi
   
   RUN dnf -y install openmpi-devel wget && \
       dnf clean all
   
   RUN wget https://raw.githubusercontent.com/open-mpi/ompi/master/test/simple/ring.c && \
       /usr/lib64/openmpi/bin/mpicc ring.c -o /home/ring && \
       rm -f ring.c

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5. コンテナーをビルドします。

   $ podman build --tag=mpi-ring .

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6. コンテナーを起動します。このコマンドは、CPU が 4 つあるシステムではコンテナーを 4 つ起動します。

   $ mpirun \
      --mca orte_tmpdir_base /tmp/podman-mpirun \
      podman run --env-host \
       -v /tmp/podman-mpirun:/tmp/podman-mpirun \
       --userns=keep-id \
       --net=host --pid=host --ipc=host \
       mpi-ring /home/ring
   Rank 2 has cleared MPI_Init
   Rank 2 has completed ring
   Rank 2 has completed MPI_Barrier
   Rank 3 has cleared MPI_Init
   Rank 3 has completed ring
   Rank 3 has completed MPI_Barrier
   Rank 1 has cleared MPI_Init
   Rank 1 has completed ring
   Rank 1 has completed MPI_Barrier
   Rank 0 has cleared MPI_Init
   Rank 0 has completed ring
   Rank 0 has completed MPI_Barrier

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   これにより、mpirun は 4 つの Podman コンテナーを開始し、コンテナーごとに ring バイナリーのインスタンスを 1 台実行します。4 つプロセスはすべて、MPI 経由で相互に通信しています。